on février 23, 2023

Travailler avec des données NetCDF à grille irrégulièrement espacée dans R

Systèmes d'information géographique

Comment lire un fichier NetCDF en R ?

Vous pouvez lire des données netCDF dans R à l’aide du package ncdf4. Vous pouvez utiliser la fonction nc_open du package ncdf4 pour ouvrir une connexion à un fichier netCDF.

Comment extraire les données d’un fichier NetCDF à l’aide de R ?

Comment convertir NetCDF en CSV en utilisant R ?

  1. Installez ncdf4 et lubrifiez les packages.
  2. Chargez votre fichier NetCDF.
  3. Extractez les coordonnées.
  4. Conversion de temps.
  5. Extraire les variables.
  6. Exporter le résultat au format CSV.


Comment créer un fichier NetCDF dans R ?

Dans cet ensemble d’exemples de code, une trame de données R est transformée en un tableau qui peut être écrit sous forme de fichier netCDF.



4.1 Convertir une trame de données R "complète" en un tableau

  1. 1 Configuration initiale – créer des variables de dimension.
  2. 2 Remodeler un bloc de données « complet » en un tableau.
  3. 3 Vérifier la conversion.


À quoi sert NetCDF ?

NetCDF (network Common Data Form) est un format de fichier permettant de stocker des données scientifiques multidimensionnelles (variables) telles que la température, l’humidité, la pression, la vitesse et la direction du vent. Chacune de ces variables peut être affichée à travers une dimension (comme le temps) dans ArcGIS en créant une couche ou une vue de table à partir du fichier netCDF.

Le netCDF est-il une trame ou un vecteur ?

ArcGIS prend actuellement en charge trois types de données matricielles multidimensionnelles – GRIB, HDF et NetCDF – qui correspondent aux données matricielles multidimensionnelles stockées dans ces formats.

Comment lire des données netCDF ?

Pour lire un fichier netCDF de structure connue, vous devez :

  1. ouvrir le fichier – Spécifiez le nom du fichier et si vous souhaitez un accès en lecture-écriture ou en lecture seule.
  2. lire la variable ou données d’attribut – Lire les données ou les attributs d’intérêt.
  3. fermer le fichier – Libérer toutes les ressources associées à ce fichier.


Comment convertir les CN en CSV ?

Conversion d’un fichier (en spécifiant un nom de fichier)

Nous définissons quelques variables pour obtenir le nom du fichier d’entrée netcdf_file_, son chemin et le nom du fichier de sortie csv_file_ et son chemin. Nous ouvrons le fichier netcdf (en utilisant la méthode open_dataset()), le convertissons en dataframe (méthode to_dataframe()) et écrivons cet objet dans un fichier csv (méthode to_csv()).



Les fichiers netCDF sont-ils comprimés ?

La compression NetCDF est sans perte : les données sont exactement telles qu’elles étaient lorsqu’elles ont été lues sur le disque. Elles peuvent toujours être lues à l’aide de la même interface de programmation.

Comment puis-je savoir quel est le format de mon fichier netCDF ?

Dans un programme, vous pouvez appeler la fonction nc_inq_format (ou nf90_inq_format pour l’interface Fortran-90) pour déterminer la variante de format d’un fichier netCDF ouvert.

Comment convertir les CN en CSV ?

Conversion d’un fichier (en spécifiant un nom de fichier)

Nous définissons quelques variables pour obtenir le nom du fichier d’entrée netcdf_file_, son chemin et le nom du fichier de sortie csv_file_ et son chemin. Nous ouvrons le fichier netcdf (en utilisant la méthode open_dataset()), le convertissons en dataframe (méthode to_dataframe()) et écrivons cet objet dans un fichier csv (méthode to_csv()).

Comment ouvrir des fichiers .NC dans GrADS ?

Lecture de fichiers NetCDF et HDF avec GrADS



  1. Utilisez la commande sdfopen pour ouvrir le fichier. Cela nécessite le moins d’efforts pour l’utilisateur : il suffit de fournir le nom du fichier (ou une URL OPeNDAP) et GrADS s’occupe du reste.
  2. Utilisez la commande xdfopen pour ouvrir le fichier.
  3. Utilisez la commande open pour ouvrir le fichier.


NetCDF est-il un raster ?

À l’aide de l’outil Créer une couche matricielle NetCDF de la boîte à outils Outils multidimensionnels, vous pouvez créer une couche matricielle à partir d’une variable netCDF. La couche matricielle de sortie peut être utilisée dans d’autres outils qui acceptent les couches matricielles en entrée pour une analyse plus poussée.